Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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