Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2Q13563 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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