Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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