Protein–RNA interactions for Protein: P82930

MRPS34, 28S ribosomal protein S34, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS34P82930 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS34P82930 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms