Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBB4BP68371 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms