Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms