Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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