Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CRIP1P50238 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms