Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FNTAP49354 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTAP49354 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms