Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB1P16220 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms