Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPGDP15428 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms