Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTMAP06454 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTMAP06454 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTMAP06454 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms