Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QRK9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QRK9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QRK9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms