Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF316A6NFI3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms