Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FZD4Q9ULV1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms