Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms