Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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