Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms