Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms