Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A4GALTQ9NPC4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms