Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms