Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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