Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms