Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECW1Q76N89 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms