Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRIP1Q5VSL9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRIP1Q5VSL9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STRIP1Q5VSL9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms