Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms