Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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RPE65Q16518 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RPE65Q16518 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RPE65Q16518 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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