Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GAPVD1Q14C86 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GAPVD1Q14C86 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
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