Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms