Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
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