Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms