Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDRQ13258 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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