Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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