Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms