Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP6P55212 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms