Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERFP50548 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERFP50548 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms