Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDF5P43026 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDF5P43026 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDF5P43026 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms