Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP2P42575 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP2P42575 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP2P42575 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms