Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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