Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD247P20963 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD247P20963 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms