Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2BP0DI82 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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