Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms