Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBTB39O15060 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBTB39O15060 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms