Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CTDSP2O14595 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTDSP2O14595 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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