Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRRM4A7MD48 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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