Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA3PQ9Y6N3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCA3PQ9Y6N3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms