Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP20Q9Y6A4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP20Q9Y6A4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms