Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE2Q9Y5Z0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE2Q9Y5Z0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE2Q9Y5Z0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE2Q9Y5Z0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE2Q9Y5Z0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BACE2Q9Y5Z0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BACE2Q9Y5Z0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BACE2Q9Y5Z0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms