Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX9Q9Y5X1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX9Q9Y5X1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms