Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF1Q9Y548 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF1Q9Y548 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF1Q9Y548 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms